В рамках реформирования системы таможенных органов, предусмотренного Комплексной программой развития ФТС России на период до 2020 года, направленной на оптимизацию таможенного администрирования, 1 июля 2020 года произошла реорганизация Томской таможни путём её присоединения к Кемеровской таможне (приказ ФТС России от 26.12.2019 № 1970 «О реорганизации Томской и Кемеровской таможен»).

Как сообщили TKS.Ru в пресс-службе СТУ, Асиновский таможенный пост, Томский таможенный пост и Томский таможенный пост (Центр электронного декларирования) переподчинены Кемеровской таможне, им присвоены новые коды. Структурные подразделения объединены. Регион деятельности объединенного таможенного органа увеличился, теперь он составляет Кемеровскую и Томскую область.

Из общей штатной численности Томской таможни 64,16% должностных лиц перераспределены в штат Кемеровской таможни, 35,84% – в другие таможенные органы Сибирского таможенного управления.

- Одна из первоочередных задач таможенной службы в условиях реорганизации и совершенствования структуры таможенных органов - максимально сохранить квалифицированные кадры. В связи с этим должностным лицам Томской таможни, попадавшим под сокращение, предлагалось рассмотреть варианты дальнейшего прохождения службы в таможенных органах других регионов, - прокомментировал ситуацию начальник Кемеровской таможни Андрей Полетаев.